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Western Blot Sample Protocol - Mandarin

蛋白质印迹样本方案(Western Blot,中文) | Assay Genie
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蛋白质印迹样本方案

完整的 Western blot 中文样本方案:样品制备、SDS-PAGE 凝胶电泳、膜转移、剥离与重新检测,以及所需溶液与试剂配方和实用技巧。

作者:Sean Mac Fhearraigh 博士
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1简介

蛋白质印迹(Western blot)是一种用于确定样品中是否存在所选蛋白质的技术。首先,通过凝胶电泳根据大小分离蛋白质。此后,利用电流将蛋白质转移到膜上,通常为硝酸纤维素膜或 PVDF 膜。然后用对目标蛋白质具有特异性的抗体对膜进行染色,从而可以获取有关蛋白质的定性或半定量信息。

蛋白质印迹法可用于确定目标蛋白质的大小,并测量所表达蛋白质的量,以及目标蛋白质在经过药物、环境或遗传变化处理后可能经历的翻译后修饰。

2蛋白质印迹样本方案

使用 RIPA 缓冲液或细胞裂解缓冲液提取蛋白质后,可将蛋白质混合物样品上样至 PAGE 凝胶孔中,然后通过凝胶电泳分离蛋白质。电泳后,通过施加电流将蛋白质转移到硝酸纤维素膜或 PVDF 膜上。一旦蛋白质在膜上,就可以用针对目标蛋白质的特异性抗体进行探测,并使用二抗和检测试剂将其可视化。在本指南中可找到蛋白质印迹所需的溶液和试剂配方,以及可以自行修改的样本方案。

3所需的溶液和试剂

  • 裂解缓冲液(RIPA 缓冲液)
  • 上样缓冲液
  • 运行缓冲液
  • 转移缓冲液
  • TBS-T
  • 封闭缓冲液
  • 剥离缓冲液

4程序

4.1 样品制备

样品制备
  1. 在 RIPA 缓冲液(20 mM Tris-HCl pH 7.4、5 mM NaF、5 mM 焦磷酸钠、5 mM EDTA 中的 1% v/v NP40)中裂解细胞,并新鲜加入蛋白酶抑制剂(亮抑酶肽、PMSF、正钒酸钠)。
  2. 收集细胞裂解液,并使用 BCA 或 Bradford 测定法确定蛋白质浓度。
  3. 取 20 µg 样品,加入等体积的 2× Laemmli 缓冲液。Laemmli 缓冲液中含有 β-巯基乙醇,其作用是还原二硫键,从而使蛋白质变性。
  4. 将样品在加热块上于 95℃ 变性 5 分钟。

4.2 SDS-PAGE 凝胶电泳分离样品

SDS-PAGE 电泳
  1. 通过丙烯酰胺凝胶上的 SDS-PAGE 分离蛋白质。所用丙烯酰胺的百分比取决于目标蛋白质的分子大小。该样本方案中使用的是 10% 的凝胶。有关丙烯酰胺浓度与蛋白质最佳分离范围的指南见下表。
  2. 在两块玻璃板之间倒入分离凝胶,使凝胶凝固 1 小时。
  3. 用异丙醇将凝胶调平。为此,取 300 µL 异丙醇,小心地倒在凝胶顶部。
  4. 凝胶凝固后,可在水龙头下轻轻用水冲洗凝胶以除去异丙醇。
  5. 加入堆积凝胶,并小心地将梳子插入凝胶中,以免产生气泡。让凝胶凝结 1 小时。
  6. 将玻璃板放入凝胶电泳仪中,加入 400 mL 1× SDS-PAGE 运行缓冲液(15.1 g Trizma、94 g 甘氨酸、50 mL 10% w/v SDS、加 dH₂O 至 1 升),先将其加入内槽,确认不漏液。
  7. 移开梳子,必要时用运行缓冲液冲洗加样孔。
  8. 向选定的孔中加入 8 µL 未染色的分子量标准(ladder)和 20 µL 目标蛋白质样品。
  9. 以 25 mA/凝胶运行凝胶 1 小时 15 分钟。

4.3 凝胶配方参考

表 1:丙烯酰胺凝胶比例(丙烯酰胺浓度 % — 分离线性范围 kDa)

  • 5.0% — 57–211 kDa
  • 7.5% — 36–94 kDa
  • 10% — 16–68 kDa
  • 15% — 12–43 kDa

表 2:10% 分离凝胶配方

  • H₂O — 5.9 mL
  • 30% 丙烯酰胺双酚 — 5 mL
  • 1.5 M Tris pH 8.8 — 3.8 mL
  • 10% SDS — 150 µL
  • 10% APS — 150 µL
  • TEMED — 6 µL

表 3:堆积凝胶配方

  • H₂O — 2.7 mL
  • 丙烯酰胺双酚 — 670 µL
  • Tris pH 6.8 — 500 µL
  • 10% SDS — 40 µL
  • 10% APS — 40 µL
  • TEMED — 3 µL

5蛋白质印迹转移

转移步骤
  1. 从电泳仪上取下玻璃板,将它们放在纸巾上,用刮刀将板子撬开。
  2. 通过从凝胶底部切一个角来标记凝胶的方向。
  3. 将凝胶在转移缓冲液中孵育约 10 分钟,以除去洗涤剂。
  4. 将膜和滤纸切成凝胶尺寸。
  5. 在冰冷的转移缓冲液(5.8 g Trizma 碱、2.9 g 甘氨酸、0.37 g SDS 粉、200 mL 甲醇,加 dH₂O 至 1 L)中平衡 Whatman 滤纸 15 分钟。
  6. 在甲醇(100%)中激活聚偏二氟乙烯(PVDF)膜 20 秒,然后用 ddH₂O 洗涤并在转移缓冲液中平衡 15 分钟。
  7. 将凝胶放在三张 Whatman 滤纸(3 mm)上,然后放上已激活的 PVDF 膜。
  8. 在顶部再添加三张滤纸。
  9. 将凝胶放在最靠近黑色面的转移盒中。
  10. 清除可能形成的任何气泡,使用玻璃管轻轻将气泡滚出。
  11. 添加最后一个纤维垫,确保其被转移缓冲液完全覆盖。
  12. 牢牢关闭转移盒,注意不要移动凝胶和滤纸三明治,用白色闩锁将暗盒锁紧。
  13. 使用槽式转移系统,在 60 V 和 180 mA 下将凝胶中的蛋白质转移 60 分钟到 PVDF 膜上。
  14. 室温下,在振荡器上用 TBS-T(1× TBS 和 0.1% v/v Tween 20)中的 5% 蛋白质将 PVDF 膜封闭 30 分钟。
  15. 在与一抗孵育之前,室温下用 TBS-T 洗涤 5 次,每次 5 分钟。
  16. 加入一抗并在冷藏室中孵育。孵育时间因抗体而异,某些情况下可以过夜。
  17. 用 TBS-T 洗涤 5 次,每次 5 分钟。
  18. 用含有酶标记(例如 HRP)的二抗孵育膜。
  19. 重复步骤 17。
  20. 使用增强化学发光(ECL)试剂,或在暗室中将膜暴露于 X 射线胶片,使 PVDF 膜上的蛋白条带显影。
  21. 为确保每个孔上样均等,可对印迹进行微管蛋白或相关管家基因的探测。

6蛋白质印迹剥离和重新检测

剥离与重新检测
  1. 将 PVDF 膜与剥离缓冲液(62.5 mM Tris-HCl pH 7.8、100 mM 巯基乙醇、2% w/v SDS)在 50℃ 下孵育 30 分钟。
  2. 在平台摇床上不断搅拌下,室温洗膜:两次每次 5 分钟,一次 10 分钟,再两次每次 5 分钟。
  3. 室温下,在封闭溶液中轻轻搅拌孵育 1 小时进行封闭。
  4. 洗涤 2 次每次 5 分钟,然后与适当的一抗和二抗孵育。

7蛋白质印迹溶液与试剂配方

上样缓冲液配方(2×)

  • 100 mM Tris-HCl(pH 6.8)
  • 200 mM DTT
  • 4% SDS
  • 0.2% 溴酚蓝
  • 20% 甘油
  • (应在使用缓冲液前从 1 M 原液中加入 DTT)

运行缓冲液配方

  • 15.1 g Trizma
  • 94 g 甘氨酸
  • 50 mL 10% w/v SDS
  • 加 dH₂O 至 1 升

转移缓冲液配方

  • 5.8 g Trizma 碱
  • 2.9 g 甘氨酸
  • 0.37 g SDS 粉末
  • 200 mL 甲醇
  • 加 dH₂O 至 1 L

TBS-T 配方

  • 20 mM Tris,pH 7.5
  • 150 mM NaCl
  • 0.01% Tween 20

封闭缓冲液

  • TBS-T 中的 5% Marvel(脱脂奶粉)

剥离缓冲液

  • 62.5 mM Tris-HCl,pH 7.8
  • 100 mM 巯基乙醇
  • 2% w/v SDS

8帮助提示

  • 由于蛋白质印迹需要花费大量时间和精力,因此始终要从高质量的样品开始。不良的蛋白质提取和制备技术将导致不良的印迹结果,更重要的是浪费时间。
  • 制作凝胶可能会很麻烦,尤其是当返回后发现凝胶尚未凝固时——可能是因为忘记加入了某种成分。可通过倾斜设备检查凝胶是否凝结,如果仍是液体,最省时的选择通常是重新开始;如条件允许,商业预制凝胶也是一种解决方案。
  • 在转移阶段,很容易忘记凝胶而使其干涸,这会导致不良的印迹。电泳之后,为避免这种情况,请始终将凝胶置于一些转移缓冲液中,这样也有时间切割和准备 Whatman 滤纸与 PVDF 膜;也可以批量准备并储存备用。
  • 不要低估摇床的转速设置,将其调整到正确的速度(不要太快或太慢)。摇床太快,抗体将无法正确结合;太慢则可能发生不均匀结合。
  • 如重复使用抗体,请始终在侧面标记重复使用的次数,这有助于解释印迹为何突然表现异常。
  • 确保使用正确的上样对照,但不一定总是 GAPDH;具体取决于样品类型,请参考下表选择建议的上样对照。
提示:上样对照的选择应与样品类型匹配。全细胞/胞质蛋白可用 β-肌动蛋白、α-肌动蛋白(43 kDa)、GAPDH(30–40 kDa)、β/α-微管蛋白(55 kDa),高分子量样品可用黏着斑蛋白(116 kDa);线粒体样品可用 VDAC1/porin(31 kDa)、细胞色素 C 氧化酶(16 kDa);核蛋白可用 Lamin B1(66 kDa)、TATA 结合蛋白 TBP(38 kDa)、PCNA(29 kDa)、组蛋白 H1/H3;血清样本可用转铁蛋白(77 kDa);肌肉样本可用 SDHA(73 kDa)。

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